Információ

Mik azok a „horgonyzónák” az emberi genomban?

Mik azok a „horgonyzónák” az emberi genomban?



We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Olvastam ezt a cikket "A háromdimenziós kromatin interaktóma nagy felbontású térképe emberi sejtekben" címmel, a 3D kromatin interaktómáról.

Ezután a fenti algoritmust alkalmaztuk a 518 032 horgonyzórégió az emberi genomban, amelyek mindegyike egy vagy néhány HindIII restrikciós fragmentumot tartalmaz (a 2 kilobázisnál (kb) rövidebb fragmentumok egyesülnek) (2a. ábra), és összesen 1 116 312 kromatin kölcsönhatást tártak fel 0,1 téves felfedezési rátával (FDR)

Egyszerű kérdések: melyek ezek a horgonyzónák az emberi genomban?

Hogyan csoportosíthatnám őket típusokba/kategóriákba?

Kösz


Jó kérdés. A horgonyzónák olyan régiók, amelyek a nukleáris mátrixhoz kapcsolódnak. Pontosabban, az eukarióta szervezetekben a kromatin a magmátrixhoz van rögzítve rövid, körülbelül 100-2000 bp hosszúságú DNS-szekvenciákkal, amelyeket mátrix kapcsolódási régióknak vagy MAR-nak neveznek. Kérdése második részének megválaszolásához a horgonyrégióknak számos kategóriája van (és vélemények ezekről a kategóriákról). Úgy gondolom azonban, hogy a régiók kategorizálásának legátfogóbb módja az, hogy konstitutívan (mindig) vagy átmenetileg (néha) kötődnek a nukleáris szerkezethez.